京都大学理学研究科化学専攻杉山研究室（生物化学　Chemical Biology）

Welcome to Sugiyama Lab

2018.03.20
杉山　弘先生が第７０回日本化学会賞受賞しました。
2018.02.09
第4回生体分子科学シンポジウムを開催しました。
2017.10

化学のフロンティアのレポート用資料はこちらになります。
report1
report2
report3
2017.7

朴先生が第10回資生堂(Shiseido)女性研究者サイエンスグラントを受賞しました。
“生物化学、DNAのらせん構造に基づく金属酵素の開発と不斉合成への反応（DNAの二重らせん構造に基づくバイオハイブリッド触媒を開発し、それを利用して有用な化合物を合成します）"
http://www.nikkei.com/article/DGXLASDZ07HFZ_X00C17A7000000
2017.3

河本佑介さん(D2)が日本化学会第97春季年会で口頭発表を行い、学生講演賞を受賞しました。
“Visualization of human telomeres with pyrrole-imidazole polyamides targeting human telomeric repeats”
2017.1

杉山先生の御還暦をお祝いして、リーガロイヤルホテル京都にて還暦お祝いの会を開催しました。
2017.1

岡村和泉さん（M2）の論文がChemistry Letters誌のEditor's Choiceに選定されました。
http://www.journal.csj.jp/doi/abs/10.1246/cl.161024
2016.12

日高拓也さん(M1)が第39回日本分子生物学会年会でポスター発表を行い、優秀ポスター賞を受賞しました。
"ミトコンドリアDNAを標的とした配列選択的DNA結合能を有する機能性分子の開発"
2016.11

河本佑介さん(D2)がProf. Hanbin Mao (Kent State University, USA)の研究室を訪問しました。
2016.8

Anandhakumar Chandran さん(PD)が Puthiya Thalaimurai Tamizhan award 2016 science 部門を受賞しました。
2016.6

河本佑介さん(D2)と谷口純一(D2)さんがGordon Research Conference -Bioorganic Chemistry- (Andover, USA)でポスター発表を行いました。
2016.3

柏﨑玄伍さん(PD)が日本化学会第96春季年会で口頭発表を行い、学術講演賞を受賞しました。"Comparison of DNA-Binding Selectivities of PI Polyamides with Different Designs by a Next-Generation Sequencer"
2016.3

延山知弘さん(M1)が新学術領域「分子ロボティクス」領域会議において、若手ディスカッション賞を受賞しました。
2016.3

木崎誠一朗さん(D2)がProf. Thomas Carell (Ludwig Maximilian University of Munich, Germany), Prof. Marie-Paule Teulade-Fichou (Curie Institute, France), Prof. Andreas Marx (University of Konstanz, Germany), Prof. Shana Sturla (ETH Zurich, Switzerland)の研究室を訪問しました。

393. TAMRA-Polypyrrole for A/T Sequence Visualization on DNA Molecules
Lee, S.; Kawamoto, Y.; Thangavel, V.; Park, J.; Bae, J.; Kim-Ha, J.; Sugiyama, H.; Jo, K.
Nucleic Acids Research in press
392. Biomimetic Artificial Epigenetic Code for Targeted Acetylation of Histones
Taniguchi, J.; Feng, Y.; Pandian, G.; Hashiya, F.; Hidaka, T.; Hashiya, K.; Park, S.; Bando, T.; Ito, S.; Sugiyama, H.
J. Am. Chem. Soc. in press
391. Environment-dependent Self-assembly of DNA Origami Lattices on Phase-separated Lipid Membranes
Sato, Y.; Endo, M.; Morita, M.; Takinoue, M.; Sugiyama, H.; Murata, S.; Nomura, S.; Suzuki, Y.
Adv. Mater. Interfaces in press
390. RUNX1 Positively Regulates the ErbB2/HER2 Signaling Pathway through Modulating SOS1 Expression in Gastric Cancer Cells
Mitsuda, Y.; Morita, K.; Kashiwazaki, G.; Taniguchi, J.; Bando, T.; Obara, M.; Hirata, M.; Kataoka, R. T.; Muto, M.; Kaneda, Y.; Nakahata, T.; Liu, P. P.; Adachi, S.; Sugiyama, H.; Kamikubo, Y.
Scientific Reports in press
389. Complexing DNA Origami Frameworks through Sequential Self-assembly Based on Directed Docking
Suzuki, Y.; Sugiyama, H.; Endo, M.
Angew. Chem. Int. Ed. in press
388. A Synthetic DNA-binding Inhibitor of HES1 Alters the Notch Signaling Pathway and Induces Neuronal Differentiation
Wei, Y.; Pandian, G.; Yu, Z.; Zou, T.; Li, Y.; Darokar, J.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
ACS Omega 2018, 3, 3608-3616.
387. Pip-HoGu: an Artificial Assembly with Cooperative DNA Recognition Capable of Mimicking Transcription Factor Pairs
Yu, Z.; Guo, C.; Wei, Y.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
J. Am. Chem. Soc. 2018, 140, 2426-2429.
386. Triggering Nucleic Acid Nanostructure Assembly by Conditional Kissing Interactions
Azema, L.; Bonnet-Salomon, S.; Endo, M.; Takeuchi, Y.; Durand, G.; Emura, T.; Hidaka, K.; Dausse, E.; Sugiyama, H.; Toulme, JJ.
Nucleic Acids Res. 2018, 46, 1052-1058.
385. Simultaneous Binding of Hybrid Molecules Constructed with Dual DNA-binding Components to a G-quadruplex and its Proximal Duplex
Asamitsu, S.; Obata, S.; Phan, A. T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
Chem. Eur. J. 2018, 24, 4428-4435.
384. Sequence-specific DNA Binding Pyrrole-Imidazole Polyamides and Their Applications
Kawamoto, Y.; Bando, T.; Sugiyama, H.
Bioorg. Med. Chem. 2018, 26, 1393-1411.
383. RUNX Transcription Factors Potentially Control E-Selectin Expressions in the Bone Marrow Vascular Niche of Mice
Morita, K.; Tokushige, C.; Maeda, S.; Kiyose, H.; Noura, M.; Iwai, A.; Yamada, M.; Kashiwazaki, G.; Taniguchi, J.; Bando, T.; Hirata, M.; Kataoka, T. R.; Nakahata, T.; Adachi, S.; Sugiyama, H.; Kamikubo, Y.
Blood Advances 2018, 5, 509-515.
382. Targeting G-quadruplex DNA as Cognitive Function Therapy for ATR-X Syndrome
Shioda, N.; Yabuki, Y.; Yamaguchi, K.; Onozato, M.; Li, Y.; Kurosawa, K.; Tanabe, H.; Okamoto, N.; Era, T.; Sugiyama, H.; Wada, T.; Fukunaga, K.
Nature Medicine in press.
381. DNA Origami Scaffolds as Templates for Functional Tetrameric Kir3 K+ Channels
Kurokawa, T.; Kiyonaka, S.; Nakata, E.; Endo, M.; Koyama, S.; Mori, E.; Tran, N. H.; Dinh, H.; Suzuki, Y.; Hidaka, K.; Kawata, M.; Sato, C.; Sugiyama, H.; Morii, T.; Mori, Y.
Angew. Chem. 2018, 57, 2586-2591.
380. Investigating Nucleosome Accessibility for MNase, Fe^II Peplomycin, and Duocarmycin B₂ by Using Capillary Electrophoresis
Zou, T.; Kizaki, S.; Sugiyama, H.
ChemBioChem. 2018, 19, 664-668.
379. G-Quadruplex Induction by the Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamide Dimer
Obata, S.; Asamitsu, S.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
Biochem 2018, 57, 498-502.
378. UVA Irradiation of ^BrU-Substituted DNA in The Presence of Hoechst 33258
Saha, A.; Kizaki, S.; Han, J. H.; Yu, Z.; Sugiyama, H.
Bioorg. Med. Chem. 2018, 26, 37-40.
377. Evaluation of Alkylating Pyrrole-Imidazole Polyamide Conjugates by a Novel Method for High-Throughput Sequencer
Kashiwaszaki, G.; Maeda, R.; Kawase, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
Bioorg. Med. Chem. 2018, 26, 1-7.
376. Autonomous Feedback Loop of RUNX1-p53-CBFB in Acute Myeloid Leukemia Cells
Morita, K.; Noura, M.; Tokushige, C.; Maeda, S.; Kiyose, H.; Kashiwazaki, G.; Taniguchi, J.; Bando, T.; Yoshida, K.; Ozaki, T.; Matsuo, H.; Ogawa, S.; Liu, P. P.; Nakahata, T.; Sugiyama, H.; Adachi, S.; Kamikubo, Y.
Sci. Reports 2017, 7, 16604.
375. Single-Molecule Observation of The Photo Regulated Conformational Dynamics of DNA Origami Nanoscissors
Willner, E.; Kamada, Y.; Suzuki, Y.; Emura, T.; Hidaka, K.; Dietz, H.; Sugiyama, H.; Endo, M.
Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 15324-15328.
374. A Combination of Visible-Light Photoredox and Metal Catalysis for the Mannich-Type Reaction of N-Aryl Glycine Esters
Okamura, I.; Park, S.;Han, J.;Notsu, S.;Sugiyama, H.
Chem. Lett. 2017, 46, 1597-1600.
373. Effective Anti-mRNA Oligonucleotides Show High Releasing Rate of MicroRNA from RNA-Inducing Silencing Complex (RISC)
Ariyoshi, J.; Matsuyama, Y.; Kobori, A.; Murakami, A; Sugiyama, H.; Yamayoshi, A.
Nucleic Acid Ther. 2017, 27, 303-308.
372. A Synthetic DNA-binding Inhibitor of SOX2 Guides Human Induced Pluripotent Stem Cells to Differentiate into Cardiac Mesoderm
Taniguchi, J.; Pandian, G.; Hidaka, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Kim, K. K.; Sugiyama, H.
Nucleic Acids Res. 2017, 45, 9219-9228.
371. Paradoxical enhancement of leukemogenesis in acute myeloid leukemia with moderately-attenuated RUNX1 expressions
Morita, K.; Maeda, S.; Suzuki, K.; Kiyose, H.; Taniguchi, J.; Liu, P.P.; Sugiyama, H.; Adachi, S.; Kamikubo, Y. , Blood Adv. 2017, 1, 1440-1451.
370. Protein-driven RNA nanostructured devices that function in vitro and control mammalian cell fate
Shibata, T.; Fujita, Y.; Ohno, H.; Suzuki, Y.; Hayashi, K.; Komatsu, K.; Kawasaki, S.; Hidaka, K.; Yonehara, S.; Sugiyama, H.; Endo, M.; Saito, H., Nature Comm. 2017, 8, 540.
369. Antiproliferative and Apoptotic Activities of Sequence-Specific Histone Acetyltransferase Inhibitors
Yu, Z.; Taniguchi, J.; Wei, Y.; Pandian, G.N.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H. , Eur. J. Med. Chem. 2017, 138, 320-327
368. Creation of a Synthetic Ligand for Mitochondrial DNA Sequence Recognition and Promoter-Specific Transcription Suppression
Hidaka, T.; Pandian, G.; Taniguchi, J.; Nobeyama, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H. , J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 8444-8447.
367. Copper-containing DNA-Silica Mineral Complexes for the Asymmetric Diels-Alder Reaction
Sakashita, S.; Park, S.; Sugiyama, H. Chemistry Letters. 2017, doi:10.1246/cl.170411.
366. Holliday junction resolvases mediate chloroplast nucleoid segregation
Kobayashi, Y.; Misumi, O.; Odahara, M.; Ishibashi, K.; Hirono, M.; Hidaka, K.; Endo, M.; Sugiyama, H.; Iwasaki, H.; Kuroiwa, T.; Shikanai, T.; Nishimura, Y. Science. 2017, 356, 631-634.

365. Development of a Vivid FRET System Based on a Highly Emissive dG-dC Analogue Pair
Han, J.; Yamamoto, S.; Park, S.; Sugiyama, H. Chem. Eur. J. 2017, 23, 7607-7613.

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Department of Chemistry,
Graduate School of Science Kyoto University
Kitashirakawa-Oiwakecho, Sakyo-Ku, kyoto, Japan

TEL +81-75-753-4002
FAX +81-75-753-3670

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