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菊川 耕太郎Kotarou Kikukawa

学年  : 修士課程2年
血液型 : A型
専門  : 生物物理・物理化学
連絡先 : k.kikukawa at kuchem.kyoto-u.ac.jp
略歴  : 埼玉県生まれ、埼玉県育ち
趣味  : 研究(と言えるようになりたい……)
コメント: 好きな数字は205です
 

 


研究内容・業績

研究テーマ

紅色光合成細菌rhodopseudomonas palustris中に存在する青色光センサータンパク質PapBは青色光を検知するとPapAと呼ばれる酵素タンパク質を活性化させ、バイオフィルム形成のセカンドメッセンジャーであるc-di-GMPを分解することでバイオフィルム(シンクのぬめりやプラークの成分)の形成を妨げます。PapBに光を当てたときの拡散計数変化を過渡回折格子法で追跡し、円偏光二色性(CD)測定による二次構造変化測定やゲルろ過によるサイズ変化の追跡と組み合わせてPapBの反応スキームを求めています。

シアノバクテリア由来のタンパク質であるKaiA,B,CはATPをエネルギーとしてほぼ24時間周期で反応するタンパク質であり、体内時計の役割を果たすとされています。通常のタンパク質の反応がマイクロ病からミリ秒、長くてもせいぜい数秒単位で終わるのに対しKaiタンパクの24時間周期での反応は異色であり、さまざまな観点から研究が進められています。このタンパク質をSAXS等の分光学的手法や熱膨張係数などの熱力学量を測定する手法を用いて性質を解明する試みを行っています。


業績

ポスター発表
Light induced reaction dynamics of a BLUF photoreceptor PapB
『第51回日本生物物理学会年会』 2013.10.30@京都



 






photo-physical-chemistry lab,京都大学大学院理学研究科 化学専攻 光物理化学研究室

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